甘肅省在財力有限的情況下，不斷加大對污染減排工作的資金投入，完善激勵機制，用好經濟杠桿。
目前，省級主要污染物總量減排專項資金從“十一五”初期的每年5000萬元，提高到2013年的1.5億元。2012年，甘肅省財政廳、省環保廳共安排污染減排專項資金1.108億元，安排環保專項資金6980萬元，對全省142個重點減排項目和蘭州市28家省屬行政事業單位燃煤鍋爐清潔能源改造工程，給予資金補助。
對日產2000噸以上的現役新型干法水泥生產線脫硝改造工程，每個項目補助150萬元;對現有不達標污水處理廠脫氮除磷改造項目，每個項目補助150萬元。
“十二五”前兩年，通過建立完善減排經濟政策，在全省GDP年均增長12%以上、規模以上工業增加值年均增長14%以上的情況下，甘肅省較好完成了4項主要污染物減排任務。